W prawej części ambitu, przy zakrystii znajdują się schody prowadzące do krypty zmarłych biskupów łódzkich. Przed remontem zejście zabezpieczone było mosiężną płytą, która następnie wbudowana została w posadzkę w krypcie. Na płycie umieszczony jest herb biskupa W. Tymienieckiego oraz data A.D. 1935. Krypta znajduje się pod zakrystią, posiada żelbetowy strop i ściany z piaskowca. Znajdują się w niej sarkofagi biskupów: Wincentego Tymienieckiego, Włodzimierza Jasińskiego, Michała Klepacza i Józefa Rozwadowskiego. Krypta jest dostępna dla odwiedzających. W listopadzie w krypcie zmarłych biskupów łódzkich odprawiane są msze św. żałobne połączone z wypominkami oktawalnymi.